40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1636 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  96.34 
 
 		 191 aa  373  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  88.48 
 
 		 191 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  84.82 
 
 		 191 aa  340  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  83.77 
 
 		 191 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  84.29 
 
 		 191 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  83.77 
 
 		 191 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  81.68 
 
 		 191 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  54.97 
 
 		 192 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  55.49 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  50.79 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  53.89 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  50 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  44.5 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  54.29 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  43.2 
 
 		 1042 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  36.9 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  38.8 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  37.06 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  35.29 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  34.48 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  34.1 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  33.9 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  33.9 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  32.97 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  34.57 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  35.67 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.93 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  34.5 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  34.71 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  33.16 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  36.48 
 
 		 371 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  32.93 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  23.87 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  23.03 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  27.07 
 
 		 171 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  24.48 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>