More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3690 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  383  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  33.33 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  31.55 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  34.68 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  31.44 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  29.89 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  29.65 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  31.3 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.1 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  32.6 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32.64 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  36.43 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  31.94 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  28.06 
 
 		 220 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.1 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  31.65 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  31.76 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.15 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.36 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  29.11 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  31.45 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  28.72 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  30.05 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  28.72 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  28.72 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  30.72 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.93 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  28.35 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  28.35 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  28.35 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  28.35 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  28.35 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  28.35 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  30.43 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.25 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  34.38 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 301 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  34.78 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  35.34 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  32.26 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 		 301 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  30.77 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  28.9 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  34.15 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  34.92 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  30.85 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  34.78 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  39.56 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  38.37 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  29.37 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  29.37 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  27.54 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  29.37 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  28.48 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  28.66 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  29.84 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  26.77 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.21 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  30.61 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  31.82 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  36.08 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  25.71 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  30.48 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.78 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  28.43 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  29.45 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.29 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  32.14 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.05 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  28.47 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.06 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.77 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  33.88 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  27.22 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  32.12 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.76 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.77 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  29.19 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  31.62 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  27.05 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  31.36 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  31.43 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>