42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05610 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  34.9 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  36.93 
 
 
191 aa  94.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  33.5 
 
 
195 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  34.43 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  32.4 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  32.4 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  32.43 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  32.43 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  32.43 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  32.43 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  32.82 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  32.93 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  32.97 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  31.28 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  35.29 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  30.65 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  30.86 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  33.33 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  31.82 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  32.76 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  27.42 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  28.8 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  30.46 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  25.86 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  31.25 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  29.03 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  29.79 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  27.57 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 
1042 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  29.37 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  28.67 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  26.63 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  27.66 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  24.82 
 
 
208 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  26.26 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  27.51 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  26.96 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  28.41 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  25.95 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29.45 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>