45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1959 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  55.88 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  56.21 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  52.38 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  51.83 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  53.89 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  53.89 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  53.89 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  51.11 
 
 		 191 aa  188  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  53.49 
 
 		 191 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  52.91 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  52.91 
 
 		 191 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  52.91 
 
 		 191 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  48.44 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  44.97 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  49.49 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  40.53 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  40.72 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  39.89 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  40.43 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  41.67 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  40.72 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  38.69 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  40.48 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  35.94 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  38.24 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  36.81 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  38.92 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  39.05 
 
 		 371 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  31.18 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  37.02 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  37.02 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  31.4 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  38.6 
 
 		 1042 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  32.45 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  34.43 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  30.52 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  27.88 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  27.63 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  27.59 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  26.36 
 
 		 189 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  25.17 
 
 		 196 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  30.86 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  29.41 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  25.17 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>