39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2513 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  99.48 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  98.43 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  98.43 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  85.86 
 
 		 191 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  84.29 
 
 		 191 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  84.29 
 
 		 191 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  80.63 
 
 		 191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  81.68 
 
 		 191 aa  322  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  53.4 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  55.43 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  53.49 
 
 		 191 aa  187  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  47.12 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  49.2 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  42.41 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  50.26 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  35.26 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  36.16 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  39.64 
 
 		 1042 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  35.45 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  34.12 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  35.11 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  32.61 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  33.52 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  32.07 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  35.09 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  34.5 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  34.71 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  32.37 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  34.73 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  32.4 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  31.02 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  37.11 
 
 		 371 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  31.22 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  32.4 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  31.95 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  23.66 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  22.7 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  26.38 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>