44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2476 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  50.26 
 
 		 191 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  50.79 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  55.49 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  56 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  52.75 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  55.43 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  57.8 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  55.49 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  55.49 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  55.43 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  55.43 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  52.91 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  53.76 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  54.44 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  49.71 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  36.13 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  39.36 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  37.06 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  34.46 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  36.14 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  32.34 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  36.14 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  35.54 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  33.15 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  33.87 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.54 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  35.16 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  32.53 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  32.8 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  26.98 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  34.5 
 
 		 1042 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  33.52 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  26.59 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  33.13 
 
 		 371 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  37.43 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  26.7 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  25.57 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.62 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  26.58 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  26.58 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.05 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.05 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.23 
 
 		 182 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>