48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2061 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  57.07 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  50.26 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  49.21 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  46.77 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  44.5 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  44.5 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  43.46 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  42.41 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  41.88 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  41.88 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  41.88 
 
 		 191 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  49.13 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  42.41 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  44.97 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  46.2 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  41.95 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  38.17 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  36.17 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  37.16 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  37.1 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  35.5 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  36.47 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  36.26 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  36.26 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  35.67 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  37.57 
 
 		 1042 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  35.5 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  32.98 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  32.63 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  33.73 
 
 		 371 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  34.34 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  31.4 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  27.84 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  27.49 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  33.53 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  28.66 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  24.27 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  25.81 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  30.88 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  32.61 
 
 		 246 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  29.66 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  31.33 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  26.61 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.37 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  28.69 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29.32 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  26.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>