47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0400 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  48.68 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  54.39 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  44.88 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  37.83 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2124  YceI family protein  39.2 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.97033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0535  YceI family protein  29.17 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0918  YceI family protein  31.37 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3479  YceI family protein  28.87 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  32.5 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0502  YceI family protein  24.46 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000406201  decreased coverage  0.00000051699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2969  YceI family protein  28.74 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.08 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  31.63 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  33.8 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.12 
 
 		 421 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.08 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.69 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  30.67 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  28.09 
 
 		 181 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.12 
 
 		 177 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  29.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  25.87 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.28 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  29.85 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  27.59 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  30.43 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0504  YceI family protein  24.28 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0863373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  32.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.31 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.6 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  32.61 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  31.11 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  30.19 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  29.1 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  26.24 
 
 		 534 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.32 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  29.1 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  25.97 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  30.19 
 
 		 177 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0583  hypothetical protein  27.88 
 
 		 183 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>