39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2893 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  89.01 
 
 		 191 aa  343  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  88.48 
 
 		 191 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  88.48 
 
 		 191 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  82.2 
 
 		 191 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  81.68 
 
 		 191 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  80.63 
 
 		 191 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  80.63 
 
 		 191 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  79.06 
 
 		 191 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  55.49 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  55.88 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  49.21 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  52.38 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  48.17 
 
 		 191 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  42.41 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  55.81 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  36.36 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  37.06 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  36.69 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.26 
 
 		 1042 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  36.07 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  35.14 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  35.47 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  32.63 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  35.42 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  33.91 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  35.42 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  33.9 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  34.57 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  34.5 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  33.92 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  34.32 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.33 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  38.36 
 
 		 371 aa  111  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  33.69 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  32.93 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  25.32 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  23.38 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  29.1 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>