52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4915 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  98.32 
 
 		 196 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  42.94 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  41.07 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  39.88 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  41.18 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  42.01 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  40.83 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  36.36 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  40 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  35.14 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  32.95 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  34.59 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  32.97 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  32.97 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  35.87 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  29.19 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  31.02 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  31.02 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  30.27 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  33.33 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  31.02 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  31.02 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 1042 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  31.58 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  31.61 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  34.88 
 
 		 371 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  27.01 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  30.16 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  30.46 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  27.84 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  26.63 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  25.58 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  28.12 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  29.79 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  25 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1058  hypothetical protein  25.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  23.77 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  25.96 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  26.92 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  28.87 
 
 		 421 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  26.92 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  26.92 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  32.31 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  30.11 
 
 		 171 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  25.18 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  25.96 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  25.96 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>