More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2178 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  63.93 
 
 		 191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  58.02 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  60 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  58.13 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  56.97 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  47.1 
 
 		 441 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  39.88 
 
 		 416 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  43.48 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  40.68 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  41.77 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  39.75 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  40.37 
 
 		 421 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  37.65 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  38.04 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  40.54 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  37.25 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  35.95 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  35.03 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  37.91 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  34.05 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  36.2 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  35.03 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  35.03 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  35.03 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  35.76 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  38.69 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  34.39 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  35.03 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  38.93 
 
 		 420 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  35.03 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  33.95 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  33.89 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  30.77 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  35.03 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  34.39 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  32.79 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  35.57 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  34.62 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  35.03 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  39.61 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  34.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  34.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  36.42 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  34.39 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  33.76 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  36.31 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  36.31 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  35.67 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  32.32 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  33.93 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.48 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.96 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  33.12 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  39.63 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.7 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.07 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  39.26 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  30.73 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  36.16 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  33.52 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.76 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.76 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.76 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  37.93 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  33.59 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  36.17 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  31.76 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.76 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  32.12 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.84 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  31.25 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  35.29 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  27.44 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.53 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  34.66 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  32.93 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  37.96 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.11 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  31.52 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>