More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5859 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  91.62 
 
 		 191 aa  360  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  80.37 
 
 		 193 aa  279  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  71.2 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  71.2 
 
 		 187 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  66.12 
 
 		 186 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  70.37 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  70.37 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  69.75 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  70 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  70.37 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  69.75 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  69.38 
 
 		 187 aa  223  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  60 
 
 		 186 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  60 
 
 		 186 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  65.84 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  64.67 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  64.67 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  64.67 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  65.22 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  65.22 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  51.11 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  53.07 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  49.18 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  53.66 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  47.03 
 
 		 191 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  47.13 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  48.03 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.82 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  47.37 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  45.78 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  44.1 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  48.03 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  46.36 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  38.33 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  46.05 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  36.46 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  37.22 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  30.69 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.22 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.03 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  36.08 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  32.94 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  31.01 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  30.81 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  32.5 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.99 
 
 		 421 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  31.29 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.01 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  36.52 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  32.33 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  28.69 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.14 
 
 		 410 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  27.74 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  30.28 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  34.15 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.15 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  35.71 
 
 		 242 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  32.06 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.79 
 
 		 420 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  29.11 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.18 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.29 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  28.96 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  28.65 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.97 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.62 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.06 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.13 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.37 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  30.82 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.13 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.89 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  31.51 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.05 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  31.85 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  28.99 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  31.9 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.83 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  29.2 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  31.21 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.28 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  28.23 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  32.12 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.81 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  31.3 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  29.91 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  29.27 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  35.79 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  23.81 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.33 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.03 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  26.63 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>