More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1196 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  46.47 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  48.67 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  32.92 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  32.54 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.9 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  33.11 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  29.68 
 
 		 421 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  32.52 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  31.71 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  31.69 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.92 
 
 		 420 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  32.56 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  31.78 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  28.69 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  30.23 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  27.4 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  35.97 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  28.42 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  28.26 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  27.27 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  31.67 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.85 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  32.17 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  28.95 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.95 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  32.79 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  35.25 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  30.23 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  31.06 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  28.03 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  28.47 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  31.3 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  33.88 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  30.6 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  32.69 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  29.79 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  36.47 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  33.82 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.69 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.83 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  36.13 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.07 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.71 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.75 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.61 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.92 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  28.03 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  32.05 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.71 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  28.37 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.88 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32.62 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.58 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  29.75 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  25.95 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.61 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  31.41 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.61 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.61 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  32.84 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.36 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  28.79 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.11 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  25.76 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  27.78 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  36.07 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.81 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  31.15 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.81 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.3 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  28.79 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  28.79 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  30.43 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  29.5 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  28.28 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  29.5 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  25 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  25 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  29.13 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  29.17 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  30.89 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  34.15 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  30.61 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  26.61 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  26.61 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>