More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3803 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  94.09 
 
 
186 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  94.09 
 
 
186 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  93.55 
 
 
186 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  95.16 
 
 
186 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  95.16 
 
 
186 aa  315  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  94.62 
 
 
186 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  87.63 
 
 
186 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  87.63 
 
 
186 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  88.17 
 
 
207 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  88.17 
 
 
186 aa  300  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  88.17 
 
 
186 aa  300  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  87.63 
 
 
186 aa  294  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  87.63 
 
 
186 aa  294  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  86.56 
 
 
207 aa  293  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  76.63 
 
 
187 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  75.81 
 
 
187 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  67.39 
 
 
191 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  66.12 
 
 
191 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  65 
 
 
193 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  67.39 
 
 
187 aa  220  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  57.14 
 
 
190 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  56.42 
 
 
189 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  53.04 
 
 
190 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  56.02 
 
 
190 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  51.7 
 
 
191 aa  184  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  52.26 
 
 
194 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  48.6 
 
 
190 aa  160  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  51.95 
 
 
192 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  53.9 
 
 
193 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  45.1 
 
 
186 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  49.03 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  43.4 
 
 
186 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  47.1 
 
 
196 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  48.1 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  46.36 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  41.67 
 
 
183 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  35.56 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  38.07 
 
 
192 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  38.61 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.67 
 
 
188 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  31.69 
 
 
191 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  37.74 
 
 
192 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  36.71 
 
 
190 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  31.65 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  35 
 
 
421 aa  99  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  32.8 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  34.81 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.29 
 
 
441 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35 
 
 
420 aa  89  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  35.88 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.73 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  30.81 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  32.64 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  36.49 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  26.75 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  31.36 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  29.77 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  27.27 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.25 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.33 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  38.38 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  26.79 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.58 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.16 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  29.93 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.58 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  32.76 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  31.18 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  27.84 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  32.12 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  27.75 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  37.5 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  34.27 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  30 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  35.71 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.19 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  27.48 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  29.01 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  27.91 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35.25 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.2 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  27.48 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  31.65 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.99 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  32.43 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  26.34 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.81 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  23.76 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  30.15 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  30.25 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.88 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  45.33 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.49 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  28.26 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  26.35 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  31.15 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  25.77 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.69 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>