More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2314 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  49.72 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  46.47 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  36.31 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  37.72 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.92 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  32.41 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  35.85 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  30.61 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.86 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.22 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  35.22 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  28.31 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  26.14 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  32.65 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.85 
 
 		 441 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  31.18 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  31.41 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  35.66 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.25 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  40.23 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  36.7 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  30.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  34.88 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  32.81 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  34.13 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  30.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  30.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  32.37 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  32.86 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.89 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  31.03 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.33 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.55 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  34.03 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.21 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  33.07 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  31.52 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  34.48 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  34.48 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  34.48 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  34.29 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  33.57 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.41 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  28.76 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.78 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  33.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  31.71 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30.77 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.79 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  30.18 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.37 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  32.76 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  31.51 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  30.17 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  32.23 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  30.6 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  30.43 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  32.23 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  32.88 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  32.85 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  33.59 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.37 
 
 		 400 aa  67.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  32.81 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  29.33 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  32.76 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  32.69 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  37.04 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  31.03 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.77 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  27.42 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  30.59 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  35.77 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  33.33 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  31.9 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  30.82 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  33.56 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  30.41 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>