More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3201 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  60.87 
 
 		 192 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  61.49 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  54.35 
 
 		 191 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  51.38 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  56.25 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  45.45 
 
 		 441 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  41.03 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  39.11 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.95 
 
 		 416 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  39.35 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  37.28 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  38.99 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  37.64 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  39.41 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  38.99 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  41.53 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  41.18 
 
 		 421 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  38.36 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  38.61 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  40.52 
 
 		 420 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  37.34 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  37.34 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  35.84 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  37.34 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  38.67 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  37.36 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  36.63 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  34.86 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  38 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  36.77 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  36.21 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  35.16 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  35.33 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  35.19 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  37.97 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  35.19 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  37.97 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  36.26 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  33.52 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  36.26 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  32.97 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  32.54 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  37.97 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  37.97 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  37.97 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  37.97 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  35.12 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  37.97 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  37.97 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  34.34 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  35.85 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  32.82 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.88 
 
 		 410 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  30.86 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  31.79 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.86 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  32.89 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  34 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  29.76 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  35.15 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.68 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  33.15 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  32.73 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.02 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  29.31 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  30.6 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  27.32 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  37.5 
 
 		 406 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  31.93 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  32.5 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  28.96 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.65 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  32.58 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.72 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  29.41 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  31.21 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  31.43 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  31.82 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  29.2 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  27.49 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  28.32 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.93 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.39 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  26.84 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.42 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.61 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  33.33 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  31.25 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  28.9 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  27.65 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.23 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  31.43 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  31.53 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  29.09 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>