More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0382 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  36.26 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  38.76 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  37.72 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.61 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  40.3 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  35.98 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  37.72 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  38.64 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  36 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.71 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  34.39 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  31.87 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  32.54 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  31.52 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.29 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  39.19 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  33.53 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.85 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  36.31 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  36.31 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  31.5 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  35.15 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  33.16 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  34.78 
 
 		 190 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  34.46 
 
 		 177 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.54 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  34.16 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.71 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  32.47 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.9 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.71 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.53 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.94 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.71 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.98 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  33.33 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  31.94 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.94 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.94 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  30.9 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  38.41 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  32.39 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.28 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.01 
 
 		 441 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.4 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  28.22 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  33.93 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.35 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  39.68 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  35.37 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  34.24 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  36.61 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  29.88 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.51 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  35.33 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  32.65 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  32.91 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  32.89 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  30.63 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  32.11 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  34.57 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.76 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.73 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  35.19 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.54 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  31.13 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  40 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  30.11 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.88 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  34.33 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.74 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  32.28 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  32.28 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  35.54 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  34.97 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.79 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  35.66 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  32.12 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.05 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.94 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  37.96 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  28.48 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.14 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  30.26 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.43 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  34.29 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  31.14 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  29.61 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  28.76 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.74 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  32.42 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  38.52 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  36.3 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.9 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  33.73 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  38.52 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>