More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3506 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  86.75 
 
 		 193 aa  286  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  73.17 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  67.96 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  69.51 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  70.48 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  57.93 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  47.51 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  48.66 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  47.49 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  45.76 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  51.95 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  51.3 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  51.3 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  51.3 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  47.71 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  46.2 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  46.41 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  45.11 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  43.82 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  46.2 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  43.93 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  46.2 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  49.08 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  41.94 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  51.3 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  51.3 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  46.3 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  49.69 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  50.33 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  50.33 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  49.67 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  40.37 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  46.45 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.18 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  37.28 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  35.59 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  38.56 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  36.48 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  37.36 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  37.5 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  33.77 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  35.06 
 
 		 441 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  35.26 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34 
 
 		 420 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  33.97 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  33.12 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.92 
 
 		 421 aa  87.8  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  33.56 
 
 		 416 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  30.16 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  30.39 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  29.28 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.13 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  34.83 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.12 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.18 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  34.53 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  34.53 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  34.53 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  34.88 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  30.87 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  30.57 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.51 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  34.18 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  35.48 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  32.06 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  30.48 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  34.4 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.12 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  35.04 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.88 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.71 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  28.24 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  25.41 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  33.98 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.58 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.2 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>