More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0458 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  73.49 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  70.41 
 
 		 192 aa  240  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  69.51 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  69.57 
 
 		 196 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  62.8 
 
 		 193 aa  220  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  59.47 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  48.6 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  47.13 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  48.85 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  47.13 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  49.36 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  45.76 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  49.11 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  48.85 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  48.85 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  50.32 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  49.68 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  50.32 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  50.32 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  47.59 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  47.1 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  43.2 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  47.7 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  47.7 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  43.79 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  44.91 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  44.23 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  50.32 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  50.32 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  48.47 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  48.47 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  48.47 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  47.44 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  47.44 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  47.44 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  43.75 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  39.88 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  36.78 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  35.98 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  37.34 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  36.54 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  39.35 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  38.06 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  34.44 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.9 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  32.93 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.34 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  33.69 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  34.16 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.21 
 
 		 420 aa  89.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.61 
 
 		 421 aa  88.6  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.68 
 
 		 441 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  27.06 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  26.18 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  33.78 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.77 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  29.87 
 
 		 416 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.77 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.77 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.77 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  29.49 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  32.59 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.62 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.76 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  35.04 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  34.15 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  31.97 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  34.17 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  32.12 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  31.03 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.19 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  33.33 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.33 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  32.39 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  33.33 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  33.55 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  33.55 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.72 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.45 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  30.81 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  35.45 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.45 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  34.58 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  25.76 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>