More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0231 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0231  YceI  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  99.46 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  94.09 
 
 		 186 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  93.01 
 
 		 186 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  96.77 
 
 		 186 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  95.7 
 
 		 186 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  86.02 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  86.02 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  86.56 
 
 		 207 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  86.56 
 
 		 186 aa  298  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  86.56 
 
 		 186 aa  298  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  86.02 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  86.02 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  84.95 
 
 		 207 aa  291  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  75.27 
 
 		 187 aa  290  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  75.54 
 
 		 187 aa  289  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  66.12 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  66.3 
 
 		 191 aa  251  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  64.44 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  66.3 
 
 		 187 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  57.14 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  53.51 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  52.57 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  52.49 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  54.82 
 
 		 190 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  49.16 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  50.97 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  51.3 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  52.6 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  43.79 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  48.39 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.88 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  45.7 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  38.64 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  47.31 
 
 		 184 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  46.45 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  36.36 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  35 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  37.2 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  31.69 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.03 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  36.48 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  34.81 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.29 
 
 		 421 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  30.38 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  33.54 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.29 
 
 		 420 aa  85.9  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.86 
 
 		 441 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  35.88 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  37.16 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.32 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  32.28 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  31.76 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  30.77 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  26.85 
 
 		 416 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  29.77 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  27.27 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  34.48 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.57 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  38.38 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.73 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.91 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.16 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.09 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.95 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.2 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  34.27 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.53 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  29.25 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  29.73 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  31.18 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.58 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  25.25 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  33.09 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.13 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  35.25 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  28.78 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  27.91 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.19 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  34.44 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  32.43 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  46.67 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  28.14 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  28.24 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  26.18 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  26.29 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  36.36 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.34 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.36 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  39.78 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  35.92 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  30.05 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  30.63 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  26.72 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.17 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>