More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1935 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  60.64 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  58.49 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  56.89 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  55.49 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  53.05 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  44.85 
 
 		 441 aa  134  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.37 
 
 		 416 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  41.82 
 
 		 421 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  35.98 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  40.25 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  38.29 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  39.13 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  33.77 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  32.04 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  31.69 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  32.04 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  34.87 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  34.87 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  32.93 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  37.27 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  32.93 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  32.93 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  33.77 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  32.08 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  30.77 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  30.99 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  32.03 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  30.13 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  38.61 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  33.94 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.48 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  34.01 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  30.81 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  32.73 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  34.46 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  28.85 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  33.12 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  30.86 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  32.04 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  36.52 
 
 		 410 aa  91.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  30.91 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  32.48 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  32.48 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  32.88 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  29.94 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  31.18 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  34.57 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  29.59 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  37.29 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  28.81 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.56 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.65 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  34.66 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  34.51 
 
 		 406 aa  75.1  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  35.96 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  31.34 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  34.71 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  28.87 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  33.14 
 
 		 397 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  33.33 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  28.19 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  32.62 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32.74 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  28.24 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  32.62 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  32.62 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.64 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  34.43 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  34.51 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  30.89 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.65 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.85 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  31.65 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  29.1 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  32.88 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  32.03 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.07 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  31.36 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>