More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1711 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1711  YceI  100 
 
 		 420 aa  827    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  46.98 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  42.09 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  32.83 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  29.36 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  29.33 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  28.64 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  28.93 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  41.53 
 
 		 203 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  39.76 
 
 		 186 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.45 
 
 		 188 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  41.44 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  37.95 
 
 		 191 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  36.3 
 
 		 189 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  38.2 
 
 		 177 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  41.33 
 
 		 192 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  38.36 
 
 		 191 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  38.99 
 
 		 190 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  38.93 
 
 		 188 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  39.04 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  35.62 
 
 		 189 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  36.97 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.01 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  36.73 
 
 		 190 aa  99.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  37.09 
 
 		 186 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.9 
 
 		 191 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  34 
 
 		 192 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  32.9 
 
 		 191 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  34.23 
 
 		 193 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  34.67 
 
 		 194 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  39.04 
 
 		 188 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  36.05 
 
 		 193 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  36 
 
 		 196 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.32 
 
 		 186 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  37.71 
 
 		 178 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.14 
 
 		 222 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.64 
 
 		 186 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  34 
 
 		 189 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.64 
 
 		 186 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  34.12 
 
 		 189 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.83 
 
 		 186 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  31.13 
 
 		 183 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.78 
 
 		 199 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  39.44 
 
 		 196 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.46 
 
 		 186 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  32.57 
 
 		 190 aa  90.1  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.06 
 
 		 195 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.56 
 
 		 186 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  32.77 
 
 		 181 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.11 
 
 		 187 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  33.57 
 
 		 190 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.91 
 
 		 186 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.02 
 
 		 186 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  35.23 
 
 		 179 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.75 
 
 		 189 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.33 
 
 		 184 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  33.57 
 
 		 186 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  34.29 
 
 		 186 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  38.24 
 
 		 197 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  34.29 
 
 		 186 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  34.29 
 
 		 186 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.98 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  35.79 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.22 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  35.62 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.9 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  33.56 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  29.63 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.16 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.12 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.78 
 
 		 174 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.7 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.56 
 
 		 193 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  32.41 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.12 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  32.87 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  34.17 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.15 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  29.8 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  42.66 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.79 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.41 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  31.58 
 
 		 189 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32 
 
 		 188 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  33.57 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  29.87 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  35.25 
 
 		 207 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.43 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  32.28 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.29 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  35 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  33.57 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  34.53 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>