More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1272 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  97.58 
 
 		 207 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  337  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  337  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  86.56 
 
 		 186 aa  328  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  97.31 
 
 		 186 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  97.31 
 
 		 186 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  97.85 
 
 		 186 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  97.85 
 
 		 186 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  88.17 
 
 		 186 aa  308  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  84.95 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  84.95 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  84.41 
 
 		 186 aa  304  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  77.42 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  77.84 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  84.41 
 
 		 186 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  83.33 
 
 		 186 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  65.19 
 
 		 193 aa  237  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  61.05 
 
 		 191 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  70.27 
 
 		 187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  62.11 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  59.32 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  55.06 
 
 		 189 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  57.59 
 
 		 191 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  52.81 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  54.27 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  49.34 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  47.7 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  49.67 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  45 
 
 		 186 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  49.67 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  46.1 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  49.06 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  46.05 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  40.76 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  45.39 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  35 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  37.64 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  32.6 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  39.62 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  35 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.67 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  37.97 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  34.44 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  36.94 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.29 
 
 		 421 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  34.39 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  32.8 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  35.46 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.93 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.29 
 
 		 420 aa  87.8  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  35.11 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.14 
 
 		 441 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  28.4 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  33.52 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.32 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  28.79 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.81 
 
 		 410 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  29.63 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.52 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.61 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.33 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  35.14 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  33.58 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  32.85 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  30 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  30.77 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  27.94 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  31.03 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  34.97 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  27.98 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  33.33 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.58 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  27.94 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.16 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.43 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  28.83 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  38.46 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  31.37 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  29.77 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  32.54 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  36.28 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  27.98 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  28.14 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  26.26 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  28.92 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  29.71 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  46.48 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.65 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29.44 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.28 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  30.22 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  40.91 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  26.44 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  40.2 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  28.96 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  24.75 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  28.83 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>