More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3507 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  71.95 
 
 		 193 aa  244  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  69.51 
 
 		 190 aa  237  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  71.6 
 
 		 196 aa  237  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  68.21 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  67.07 
 
 		 190 aa  217  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  58.54 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  46.84 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  46.77 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  44.5 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  46.74 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  50.97 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  50.97 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  43.46 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  46.15 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  50.97 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  50.97 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  45.6 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  43.78 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  43.92 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  52.26 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  52.26 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  42.94 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  40.96 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  41.94 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  44.65 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  45.45 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  49.34 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  48.12 
 
 		 207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  48.12 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  48.12 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  49.34 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  49.34 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.03 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  44.52 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  36.67 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  37.29 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  39.18 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  37.43 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  37.25 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.97 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  36.54 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  34.34 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  34.27 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  35.26 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.67 
 
 		 420 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  30.29 
 
 		 416 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.9 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  32.47 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  31.58 
 
 		 421 aa  94.4  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.7 
 
 		 441 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  34.57 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  31.46 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  30.9 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  32.61 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  29.84 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  25.27 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  32 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  31.07 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.69 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.91 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  33.57 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  30.34 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  29.48 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.97 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  25.3 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.14 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  32.84 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  27.66 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  30.77 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  33.77 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  27.17 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  31.25 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.15 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.65 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  33.07 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  33.33 
 
 		 410 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  30.07 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  28.57 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.81 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  30.15 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.65 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  28.31 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  28.22 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.68 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.64 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  29.44 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.24 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.21 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.23 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  33.88 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  31.89 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  29.76 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.91 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>