More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2531 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  80.21 
 
 		 187 aa  313  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  79.14 
 
 		 187 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  67.39 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  64.4 
 
 		 191 aa  254  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  68.65 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  68.65 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  64.4 
 
 		 191 aa  253  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  68.33 
 
 		 193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  69.19 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  69.19 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  69.19 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  66.3 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  66.3 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  70.27 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  65.76 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  67.93 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  69.73 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  69.73 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  66.3 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  65.76 
 
 		 186 aa  220  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  49.44 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  51.96 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  50.28 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  50.9 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  47.98 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  44.52 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  44.94 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  42.33 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  46.06 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  46.15 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  46.45 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  43.23 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  39.31 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  41.94 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  42.58 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  32.78 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  39.35 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  34.43 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  39.87 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  35 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  28.73 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  33.12 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  29.83 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.48 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  30.39 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  31.21 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  28.89 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  31.06 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.81 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  30.28 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  34.78 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.71 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  26.09 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  31.34 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  30.58 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  27.34 
 
 		 420 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  30.89 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  32.76 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.39 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  34.06 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.21 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  24.69 
 
 		 416 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.77 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  28.48 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.53 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.42 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  31.06 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  27.54 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  27.78 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  30.5 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  29.58 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  32.88 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.31 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  30.95 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  29.59 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  27.62 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  28.37 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  27.64 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  29.59 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.36 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.37 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  29.37 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  27.35 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  31.25 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  28.1 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  26.82 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  25.67 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  33.07 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  32.12 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  27.88 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  25.71 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  25.17 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  31.11 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  27.66 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  27.97 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>