More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1204 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1204  YceI  100 
 
 		 421 aa  835    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  47.54 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  43.81 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  33.65 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  33.49 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  30.75 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  41.82 
 
 		 191 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  41.29 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.33 
 
 		 190 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  38.31 
 
 		 189 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.23 
 
 		 203 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  27.29 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  40 
 
 		 188 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  37.66 
 
 		 189 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  41.1 
 
 		 186 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  40.49 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.21 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  37.28 
 
 		 191 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  36.69 
 
 		 191 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  41.14 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  38.85 
 
 		 190 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  27.97 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  45.06 
 
 		 190 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.33 
 
 		 186 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.33 
 
 		 186 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  37.3 
 
 		 222 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.33 
 
 		 186 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  38.92 
 
 		 199 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  39.23 
 
 		 186 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  38.33 
 
 		 186 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  39.89 
 
 		 201 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.44 
 
 		 186 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  37.78 
 
 		 186 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  36.67 
 
 		 186 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  34.29 
 
 		 186 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.33 
 
 		 186 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  38.65 
 
 		 192 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  34.29 
 
 		 186 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  34.29 
 
 		 186 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  37.79 
 
 		 179 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  31.33 
 
 		 187 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  31.54 
 
 		 183 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  93.2  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  32.86 
 
 		 186 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  43.55 
 
 		 197 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.22 
 
 		 186 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.33 
 
 		 187 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  32.39 
 
 		 190 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.27 
 
 		 184 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  30.61 
 
 		 190 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  30.92 
 
 		 192 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  31.61 
 
 		 193 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  30.99 
 
 		 191 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  36.84 
 
 		 192 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.8 
 
 		 184 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  32.21 
 
 		 193 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.96 
 
 		 178 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  30.99 
 
 		 191 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.75 
 
 		 189 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  35 
 
 		 186 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  32.87 
 
 		 189 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.79 
 
 		 184 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  35 
 
 		 207 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.91 
 
 		 188 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  31.79 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  29.33 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  32.45 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  34.29 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.86 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.93 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  32.17 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.78 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  37.29 
 
 		 188 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  30.26 
 
 		 196 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.29 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  29.68 
 
 		 183 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.81 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  34.03 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.95 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.71 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  31.47 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.15 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.17 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.14 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  39.56 
 
 		 191 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.27 
 
 		 177 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  30.97 
 
 		 185 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  31.16 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>