More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0761 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  51.96 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  45.78 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  39.11 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  39.26 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.6 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  37.21 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.53 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.99 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.97 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.6 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.6 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.3 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.3 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  36.63 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  35.09 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.84 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  36.36 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  36.52 
 
 		 400 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  38.55 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  36.57 
 
 		 406 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  37.43 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.36 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.47 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.67 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.95 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  37.5 
 
 		 177 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  38.33 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.15 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  34.92 
 
 		 397 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.33 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.93 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.98 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  31.43 
 
 		 178 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  32.18 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  31.4 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  35.03 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.32 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.26 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  33.71 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  30.48 
 
 		 410 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  35.09 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  30.86 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.14 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.61 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  32.47 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  36.07 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.14 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  29.38 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.61 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.04 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.24 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.58 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  35.09 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  37.71 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.09 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18060  hypothetical protein  34.5 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.645092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.25 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.09 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.09 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  31.71 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.76 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.9 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  33.52 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  28.09 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  35.06 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.95 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  32.75 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.49 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.49 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.56 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  32.76 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  34.5 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  31.49 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.41 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  31.63 
 
 		 441 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.94 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.94 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.52 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  29.48 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.94 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  29.45 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.93 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  34.75 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  32.37 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  28.82 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  26.86 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.32 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>