More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4401 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  100 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  86.54 
 
 		 156 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  56.91 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  58.1 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  57.14 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  57.54 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  48.33 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  46.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  43.23 
 
 		 441 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  46.67 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  46.67 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  46.67 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  45.56 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  44.81 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  43.39 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  45.81 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  43.72 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  43.33 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  43.09 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  42.62 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  47.31 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  43.01 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  41.85 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  42.39 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  43.96 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  41.44 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.76 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  43.01 
 
 		 420 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  43.58 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  43.62 
 
 		 416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.22 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  43.41 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.11 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  48.3 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  41.9 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  41.34 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  41.01 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  41.34 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  41.81 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.57 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  39.89 
 
 		 421 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.22 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.89 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.02 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  44.15 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.91 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  40.45 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  43.39 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  39.67 
 
 		 177 aa  97.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  41.11 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  35 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  39.79 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  48.04 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.86 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  38.95 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.87 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  35.29 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  36.46 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  39.23 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  37.57 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.2 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  39.25 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  35.35 
 
 		 406 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.85 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  39.25 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  35.98 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  39.25 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1066  cytochrome B561  42.54 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.52 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  38.55 
 
 		 175 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  47.43 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  36.81 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  38.71 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.36 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  33.15 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  42.47 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.33 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  32.6 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  37.5 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  36.87 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.25 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.03 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.07 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.09 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.98 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  36.96 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.75 
 
 		 175 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  35.75 
 
 		 174 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.75 
 
 		 175 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  30.27 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.84 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.81 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  28.5 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>