More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1661 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  45.35 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  37.78 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.52 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.73 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.64 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  33.71 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.69 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.5 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.12 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.12 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.21 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.33 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  36.46 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.97 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.16 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.75 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.88 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.7 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.68 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.7 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  40.85 
 
 		 416 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  32.75 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  41.43 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.53 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.88 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.88 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  37.99 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  36.69 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.79 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.91 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35.23 
 
 		 420 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.68 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  36.05 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  37.21 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.05 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  30.99 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.99 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  31.55 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  37.79 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.76 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  41.35 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  33.52 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  27.78 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  39.69 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  36.64 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  35.15 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  39.69 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.17 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.17 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  33.86 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.65 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.53 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.17 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.33 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.74 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.82 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  36.43 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  34.29 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.72 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.72 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.72 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  36.43 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.72 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.72 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  35.66 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  32.45 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.06 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  33.94 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.14 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.14 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.14 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  32.95 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  35.66 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  35.38 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  39.69 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.03 
 
 		 441 aa  77.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.09 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  39.84 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  30.89 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  33.73 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  36.09 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.5 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.3 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>