More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0967 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  100 
 
 		 181 aa  363  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  38.89 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.43 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  38.42 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  38.1 
 
 		 406 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  38.17 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  40.64 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.89 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  40.45 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  35.56 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  36.51 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.97 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.46 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.46 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.75 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.46 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.83 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.43 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  36.76 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.38 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.38 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.21 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  33.85 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  35.48 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  35.45 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  38.32 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.41 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.22 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  33.87 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  36.75 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.43 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.71 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.39 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  33.89 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  38.17 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.39 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.39 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.39 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.39 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  34.39 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.39 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.39 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.39 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  37.22 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  36.2 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  37.22 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  36.02 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.33 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  35.29 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  35.33 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.33 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.33 
 
 		 204 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  32.78 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.07 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.62 
 
 		 199 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  34.48 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  30.98 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  35.16 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  36.76 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.97 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.9 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  33.51 
 
 		 397 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.97 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.07 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  33.68 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  33.16 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.77 
 
 		 420 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.26 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  34.41 
 
 		 400 aa  87.8  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  38.37 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.33 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.13 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  32.53 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  37.04 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.34 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  31.41 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  35.87 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  32.97 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  33.33 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.34 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.36 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.61 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  32.97 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  32.94 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>