More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2495 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  43.09 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  39.55 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  35.33 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.87 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  38.6 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  38.01 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.6 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.24 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.71 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  31.32 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.16 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  34.43 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  34.43 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  36.51 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.64 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.56 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.62 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.08 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  34.08 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  35.03 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.83 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.45 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  33.7 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.83 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.26 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  35.14 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  32.97 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.12 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.04 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  34.78 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.48 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  34.57 
 
 		 400 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  33.15 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  32.78 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  33.15 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  33.15 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.96 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.96 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.96 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  31.58 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  36.05 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  37.11 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  32.97 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.33 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.82 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  34.97 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.04 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  33.33 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  31.82 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  30.85 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.4 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  32.02 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.53 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  32.58 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  30.48 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  37.5 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.79 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  33.86 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  32.02 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  32.61 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  31.69 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  33.86 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  32.02 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  28.32 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.38 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.97 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  32.83 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  29.38 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  34.04 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  31.69 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.88 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.35 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  34.05 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.5 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  34.04 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  30.85 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.53 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>