More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2450 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3000  cytochrome B561  85.11 
 
 		 188 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426718  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  82.35 
 
 		 186 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  45.41 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.86 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.24 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.27 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.24 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.98 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.83 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.87 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.27 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.27 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.43 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.45 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.95 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.2 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.63 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.89 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.89 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.7 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.69 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.69 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.87 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.95 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.6 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.69 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30.6 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.46 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  34.97 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  29.28 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  34.5 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  28.98 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  31.82 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  33.86 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.97 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  34.83 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  27.81 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.44 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.4 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  30.51 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  32.8 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.43 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.43 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.78 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.25 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.76 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  29.71 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.48 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  28.18 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.98 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  32.95 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  28.26 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  31.76 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.98 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  31.76 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  31.76 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.76 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.76 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.98 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.01 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  33.89 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.98 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.05 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.98 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  33.71 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  28.09 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.09 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.79 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.57 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  32.97 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  32.97 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  33.86 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  32.77 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  32.35 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  28.57 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  28.11 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  32.28 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  32.42 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  30.77 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  32.39 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  32.39 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  25.84 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  32.95 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  30.34 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  33.33 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  32.18 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>