More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1756 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  98.86 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  98.86 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  98.86 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  76.7 
 
 		 176 aa  291  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  82.95 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  82.95 
 
 		 188 aa  241  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  82.95 
 
 		 188 aa  240  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  82.95 
 
 		 188 aa  240  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  82.95 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  82.95 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  67.05 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  65.91 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  65.91 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  50.85 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  51.69 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  46.89 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  50.56 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  42.86 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  42.86 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  47.31 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  41.71 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  41.71 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  41.71 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  42.29 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  41.71 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  41.95 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  38.86 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  41.86 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  39.64 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  38.29 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.66 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  37.14 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  38.37 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.02 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.02 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  43.02 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  35.8 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  42.44 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  41.86 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  39.18 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.11 
 
 		 186 aa  97.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  36.26 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  37.57 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  39.77 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  34.68 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  35.63 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  33.91 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  36.16 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  35.43 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  33.14 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.14 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.14 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.95 
 
 		 229 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  34.86 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  33.33 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  32.76 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.23 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  32.76 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  32.76 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  30.59 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  32.42 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  36.47 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  36.47 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.02 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.17 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.11 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  33.51 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  29.94 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.17 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  29.89 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.49 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.29 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  27.68 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  27.68 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  27.12 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  34.48 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  27.75 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  27.59 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.8 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  31.79 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  29.21 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>