More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3652 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  79.46 
 
 		 197 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  61.41 
 
 		 184 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  50.54 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.75 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.72 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.33 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.36 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.71 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  39.67 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  36.02 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.59 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.57 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  36.93 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  41.57 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.03 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  39.67 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.36 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.57 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  39.67 
 
 		 183 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  36.02 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  36.51 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.41 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  34.43 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  34.44 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.43 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.81 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  34.97 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  32.43 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.91 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.91 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  37.14 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.81 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.78 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.28 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  32.47 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  31.38 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.74 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.39 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  34.46 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.86 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.32 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  33.85 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  33.85 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.32 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.77 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.81 
 
 		 175 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  34.81 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  34.81 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  32.79 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.33 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.28 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.16 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  33.51 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  36.17 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  33.51 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  36.17 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  28.73 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  35.68 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.47 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.17 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  31.89 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  36.17 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.49 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.4 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.17 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  35.56 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  34.41 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  34.25 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  33.69 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.4 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  34.41 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  31.89 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  32.2 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.47 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.47 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.22 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.47 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  34.66 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  36.93 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  33.87 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  36.93 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  34.05 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.87 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.96 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.96 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.96 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.96 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.96 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  29.59 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.32 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>