282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0697 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  93.26 
 
 		 178 aa  313  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  54.24 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  52.54 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  60.12 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  51.69 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  52.81 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  52.25 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  52.25 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  51.69 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  51.69 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  44.57 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  44.57 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  44.57 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.57 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.57 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  44.57 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.57 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  50.28 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  50.28 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  50.28 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  51.12 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  41.48 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  41.48 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  41.48 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  41.14 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  50 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  50 
 
 		 188 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  50 
 
 		 188 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  50 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  50 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  50 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  50 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.45 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.45 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  40 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  46.45 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  45.81 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  45.16 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  43.02 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  43.6 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  43.02 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  35.59 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  40.34 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  42.44 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  40.34 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  38.69 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  44.24 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  38.6 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  39.35 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  37.36 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  38.73 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  38.92 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  38.37 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  35.47 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  40 
 
 		 191 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  34.12 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  33.72 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  32.77 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  38.42 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.4 
 
 		 229 aa  87.8  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.4 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  31.4 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  31.4 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  31.4 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  31.4 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.4 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  33.54 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  38.73 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  33.74 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  28.65 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  30.39 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  33.53 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  33.13 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  32.6 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  32.93 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.93 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  33.53 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  33.53 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  32.4 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  32.1 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.68 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  30.39 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  29.41 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  31.25 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.83 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  29.51 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.03 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  30.46 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.98 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  30.54 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.46 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0580  cytochrome b561  40 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.971319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>