More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4038 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  49.71 
 
 		 208 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  37.22 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  40 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  40 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.6 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  34.04 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.88 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  37.36 
 
 		 174 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  35.67 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  34.78 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.59 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2536  cytochrome B561  35.67 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.46 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.03 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  30.73 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.64 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.9 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.39 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.22 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.9 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.66 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  32.35 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  31.46 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.25 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  36.99 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.43 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  37.02 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.6 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  30 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  35.15 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  30.77 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  33.7 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.4 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  33.15 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.79 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.22 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  31.07 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  32.58 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.9 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.35 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  33.7 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.89 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.05 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  31.15 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  33.33 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  30.39 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.05 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.9 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  29.78 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  36.15 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.02 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.34 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.02 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.02 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.02 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.02 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.11 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  34.15 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  27.68 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  29.94 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30.9 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.32 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  31.35 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  26.78 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.32 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.39 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  33.15 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.39 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  30.41 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.53 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  31.11 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  31.11 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  33.15 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  32.09 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  30.56 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  32 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  26.6 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.23 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  29.28 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.23 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  29.55 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.18 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  29.71 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  32.04 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  28.88 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  31.02 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.56 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.65 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.33 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  26.49 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  27.68 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  30.69 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29.65 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.61 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  30.22 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>