More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2036 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  46.99 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.67 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  41.57 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  40.88 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  41.11 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  40.88 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  40.88 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  41.38 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  42.53 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  43.18 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  40.76 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.42 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  40.45 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  39.44 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  39.08 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  41.81 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.79 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.57 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  37.29 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.41 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.3 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  40.34 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  41.62 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.57 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  42.77 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.1 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.98 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.36 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  42.61 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.98 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  37.57 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  38.37 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.61 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  36.78 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  36.78 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  36.78 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  39.33 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.81 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.58 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  38.18 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  36.21 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  40 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  39.33 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.11 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.26 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  39.63 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.76 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.76 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.09 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  35.63 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.46 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  35.43 
 
 		 173 aa  101  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.08 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  34.62 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.24 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.18 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  38.18 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  38.41 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.18 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.93 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  34.27 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.91 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.91 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.27 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  40.12 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  40.12 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  37.58 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  33.88 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  40.22 
 
 		 406 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  36.36 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.14 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.26 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  38.37 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  33.15 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.05 
 
 		 181 aa  94.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  37.71 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.16 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.16 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.16 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.16 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  36.16 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  34.46 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.99 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  36.21 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  35.63 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  36.16 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  33.52 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  33.69 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.36 
 
 		 416 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.21 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.75 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  34.46 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>