265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2536 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2536  cytochrome B561  100 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  35.67 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  37.97 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.38 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  35.8 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  36.42 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  35.56 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  35.56 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  31.38 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  30.29 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.59 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  34.48 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  31.38 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  31.38 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.98 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  29.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  29.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.55 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.67 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  32.4 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  30 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.64 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.59 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.16 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.21 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.26 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.48 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.48 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  31.28 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  32.75 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.84 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  31.28 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  32.37 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.91 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.54 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.58 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.19 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  32.16 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32.58 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.36 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  35.36 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.37 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  35.36 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  35.36 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  35.36 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.79 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.14 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.93 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  31.03 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  34.81 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  31.18 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.57 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.52 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  30 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  34.81 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  31.03 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  33.53 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.17 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  35.2 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.61 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.25 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.32 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  31.9 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.25 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  31.4 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.11 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  32.12 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  28.22 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.13 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.57 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  35.96 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  29.05 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  27.33 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  27.33 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  31.69 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.86 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  29.14 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  31.87 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  28.11 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  26.71 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  30.56 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  29.31 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  27.61 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  30.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  26.71 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  31.87 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.14 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1042  cytochrome B561  28 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  29.65 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>