More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7129 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  44 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  41.42 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  42.01 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  41.42 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  38.82 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  39.64 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.37 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  38.01 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  38.6 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  38.6 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  38.6 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  38.6 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.85 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.84 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.99 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  38.51 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.14 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.9 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.57 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.26 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  33.53 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  36.84 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.5 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.16 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.52 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.67 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.84 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  35.67 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.53 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.33 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  32.74 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.57 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.88 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.63 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  38.89 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.34 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.43 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.96 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  34.5 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  37.65 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.75 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  33.53 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32.39 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  32.78 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  33.33 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.46 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.95 
 
 		 197 aa  84.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  32.75 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.5 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.98 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  33.13 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  33.53 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.11 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  34.46 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.56 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  37.57 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.56 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  39.31 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  36.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.5 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  32.39 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.5 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.59 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.56 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  32 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  36.93 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.66 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  33.14 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.73 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  35.98 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.81 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.7 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  28.49 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  28.66 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  28.66 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.19 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.46 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.19 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.49 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  27.43 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  27.01 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  32.94 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.75 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  29.48 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>