282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1464 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  100 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.33 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.33 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.15 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  36.07 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  30.86 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  34.29 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.96 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  26.59 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  37.71 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.36 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.91 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  36.93 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.93 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.64 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  29.31 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  29.83 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  32.22 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.64 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.27 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  30.23 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.33 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.51 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.39 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.03 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.76 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  31.21 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.77 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.76 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.15 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  33.52 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.94 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  26.7 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  30.51 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  30.77 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30.54 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  34.46 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.46 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.54 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.81 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32.75 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  30.94 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  31.95 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  32.02 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.64 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.54 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  27.68 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.27 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  27.68 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  29.44 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  27.68 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  29.89 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.55 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  29.31 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  29.31 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  31.07 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  32.56 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  33.71 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  28.09 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  32.56 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  33.33 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  27.53 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.94 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  32.93 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  29.31 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6235  cytochrome B561  34.29 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  27.01 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.93 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  27.93 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  30.28 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  31.28 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  28.49 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  28.89 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  30.27 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  32.57 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  30.34 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  31.28 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.17 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  28.25 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.25 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  33.02 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.81 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  33.59 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.6 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  34.53 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>