More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3459 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  100 
 
 
177 aa  343  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  94.29 
 
 
180 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  85.31 
 
 
177 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  55.43 
 
 
179 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  58.08 
 
 
190 aa  170  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  53.29 
 
 
175 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  53.29 
 
 
174 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  53.29 
 
 
175 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  53.29 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  51.98 
 
 
178 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  53.49 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  52.1 
 
 
176 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  51.5 
 
 
176 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  50 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  48.28 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  50.29 
 
 
176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  50.29 
 
 
176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  50.88 
 
 
176 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  56.57 
 
 
179 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  51.19 
 
 
188 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  51.19 
 
 
188 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  54.55 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  48.81 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  48.81 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  50.29 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  53.37 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  47.65 
 
 
177 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  48.82 
 
 
177 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  52 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  52 
 
 
188 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  55.23 
 
 
200 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.53 
 
 
178 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  51.16 
 
 
174 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.93 
 
 
182 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  38.59 
 
 
185 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  40.59 
 
 
174 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.42 
 
 
189 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.71 
 
 
186 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.76 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.71 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.87 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.99 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  38.15 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.8 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.05 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.36 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.99 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.04 
 
 
222 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  41.24 
 
 
186 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.51 
 
 
199 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.87 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.46 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.86 
 
 
178 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.08 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.5 
 
 
197 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.66 
 
 
196 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.58 
 
 
195 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.16 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  36.26 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.16 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.9 
 
 
441 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.94 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.3 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.47 
 
 
186 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.39 
 
 
186 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  32.04 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.3 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.3 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.3 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.14 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.57 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.88 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.81 
 
 
203 aa  87.4  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.22 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.1 
 
 
188 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.72 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  28.4 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  37.58 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.57 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.41 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35.03 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.81 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  35.96 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.72 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  37.08 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  37.57 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  36.42 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.59 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.78 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.52 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.16 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.84 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.64 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  34.83 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  40.69 
 
 
416 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  34.5 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  33.53 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  30.06 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.39 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>