More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6723 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  100 
 
 		 180 aa  349  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  94.29 
 
 		 177 aa  294  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  83.33 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  55.62 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  58.14 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  55.09 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  53.89 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  53.89 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  53.89 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  54.34 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  53.18 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  51.5 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  57.06 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  52.1 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  52.1 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  50.9 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  52.69 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  52.1 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  50.3 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  55.76 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  50.29 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  50.29 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  50 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  50 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  50 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  54.86 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  52.66 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  50.6 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  48.19 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  52.66 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  54.86 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  50.57 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.88 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.57 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  39.88 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  37.57 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  39.64 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.47 
 
 		 189 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.93 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.05 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  39.33 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.87 
 
 		 222 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.33 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  38.95 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.29 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.12 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.06 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.27 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  36.46 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.48 
 
 		 196 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.66 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.66 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.66 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.66 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.5 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.02 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  35.84 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  36.31 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.43 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.77 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.05 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.53 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.63 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.03 
 
 		 182 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.81 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.75 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.54 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  35.88 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.92 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.05 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.71 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  32.54 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.83 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  35.84 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.51 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.36 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.6 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.84 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.15 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  27.16 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  34.48 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  33.51 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.1 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.84 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  32.52 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.08 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.95 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  40.56 
 
 		 416 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  36.36 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.98 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.69 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  30.9 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  37.71 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.42 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  38.46 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  37.28 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  33.69 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  36.96 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  34.73 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.58 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>