More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2896 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  94.35 
 
 		 177 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  94.35 
 
 		 177 aa  303  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  84.75 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  58.76 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  55.81 
 
 		 175 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  55.81 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  55.23 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  60 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  55.62 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  61.76 
 
 		 178 aa  171  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  58.9 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  57.67 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  57.06 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  56.44 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  56.44 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  62.87 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  56.44 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  56.44 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  59.32 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  60.59 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  52.1 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  52.25 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  52.25 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  52.41 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  48.82 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50.6 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  58.08 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  56.89 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  47.06 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  54.44 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  42.37 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  43.37 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  40.88 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  43.45 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  52 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.38 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.63 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.85 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.01 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.62 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.02 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.68 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.14 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  40 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  39.18 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.91 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.36 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.42 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  29.24 
 
 		 181 aa  84.3  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.64 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  37.87 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  38.42 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.84 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.15 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  37.28 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  37.21 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  39.08 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  32.96 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.21 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.01 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  33.68 
 
 		 410 aa  80.9  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.23 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.71 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.75 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.27 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  38.18 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  34.13 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.8 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.2 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.98 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  42.13 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  29.94 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.8 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  37.13 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.15 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.29 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.91 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.15 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.15 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.65 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.11 
 
 		 416 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  30.63 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.48 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  37.2 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.78 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.86 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  40.48 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.71 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  28.99 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  32.02 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.06 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  31.58 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>