274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0296 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  332  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  76.11 
 
 		 188 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  77.46 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  73.6 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  55.49 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  55.81 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  52.02 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  55.88 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  50.29 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  50.29 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  50.29 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  51.45 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  53.01 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  51.45 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  51.45 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  50 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  49.41 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  49.41 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  48.82 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  55.49 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  54.49 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  54.49 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  52 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  51.43 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  48.88 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  55.29 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50.57 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  50.87 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  50.29 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  49.71 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  48.86 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  52 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  39.66 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  40.23 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  37.36 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.21 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  37.99 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.2 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.24 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.21 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.99 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.35 
 
 		 186 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.26 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.63 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.43 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.36 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.89 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  35.43 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.76 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.43 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.27 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.15 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  39.64 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  30.77 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.91 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.12 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.04 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.37 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.23 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.11 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.81 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.56 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.27 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  29.1 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.2 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.91 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.65 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  42.2 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.37 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  34.48 
 
 		 416 aa  71.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  30.81 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.7 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.94 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.15 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.62 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.73 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  36.22 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  31.76 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.18 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  34.97 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.76 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.07 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.27 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  33.51 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  32.42 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.18 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  30.64 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  32.57 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.41 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  30.23 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  29.03 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>