More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0086 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  100 
 
 
175 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  98.86 
 
 
175 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  98.85 
 
 
174 aa  330  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  95.43 
 
 
175 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  80.35 
 
 
176 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  80.23 
 
 
177 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  80.35 
 
 
176 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  80.35 
 
 
176 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  79.77 
 
 
176 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  80.79 
 
 
177 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  80.35 
 
 
176 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  59.3 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  64.33 
 
 
181 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  57.99 
 
 
178 aa  181  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  60.59 
 
 
177 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  60.48 
 
 
191 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  53.53 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  57.99 
 
 
188 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  57.99 
 
 
188 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  61.05 
 
 
179 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  54.65 
 
 
177 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  54.65 
 
 
177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  55.81 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  54.71 
 
 
177 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  55.81 
 
 
177 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  53.89 
 
 
180 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  53.29 
 
 
177 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  54.71 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  57.65 
 
 
188 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  55.49 
 
 
188 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  56.29 
 
 
200 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  40.57 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.31 
 
 
185 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  40.68 
 
 
184 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  48.82 
 
 
174 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.37 
 
 
174 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.47 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  41.1 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.88 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.57 
 
 
182 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.81 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36.81 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.41 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.81 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.24 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.98 
 
 
203 aa  97.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.88 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.71 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  38.04 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.29 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.01 
 
 
181 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.81 
 
 
222 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  36.63 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.53 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.71 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.63 
 
 
180 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.15 
 
 
199 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.26 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  40.96 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.63 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36.63 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.14 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.1 
 
 
186 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.68 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  40.96 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.1 
 
 
186 aa  88.2  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.84 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.84 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.97 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.64 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.8 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.09 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35.63 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.86 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.32 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.1 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  32.56 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.74 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  31.95 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  35.43 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30.81 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.18 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.13 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.54 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  34.03 
 
 
416 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  38.2 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  37.93 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  30.46 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  31.32 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  39.89 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  31.76 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  32.54 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  32.95 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.07 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.07 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  35.76 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  35.23 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  43.18 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.36 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>