More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1020 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  51.96 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  43.03 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  41.82 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  41.82 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  41.82 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  42.42 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  41.21 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  41.82 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.33 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  37.28 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.01 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.79 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  40.35 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.41 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.78 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  39.52 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.48 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.48 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  35.03 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  33.14 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.52 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.47 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.76 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.55 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.52 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.19 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.78 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  35.52 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.16 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.42 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.42 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.84 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  33.92 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.37 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  38.12 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.75 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.16 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.9 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.42 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.21 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.43 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.21 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  29.71 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  35.8 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.92 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  35.59 
 
 		 397 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  38.79 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.75 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.54 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.54 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  32.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.3 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  34.3 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  36 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.3 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.75 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.95 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.79 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.43 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.37 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.14 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  42.77 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.2 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  29.14 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.09 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  34.34 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  32.74 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.89 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.94 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  32.22 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  38.65 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  31.07 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  32.35 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  32.35 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  32.35 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.91 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  32.39 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  32.74 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  34.36 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.36 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.02 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.09 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.09 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>