More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0259 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  100 
 
 		 178 aa  343  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  76.02 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  68.82 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  68.82 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  61.4 
 
 		 190 aa  197  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  59.55 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  61.08 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  61.08 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  58.05 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  59.88 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  58.68 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  57.47 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  57.56 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  57.56 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  57.99 
 
 		 175 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  57.49 
 
 		 174 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  57.49 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  63.13 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  61.76 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  56.82 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  58.99 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  56.74 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  60.59 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  61.05 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  60.47 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  59.28 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  62.28 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  61.05 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  53.18 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  51.98 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  51.98 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  55.81 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  43.6 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  40.22 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.24 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  40.34 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  40.46 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  40.91 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  44.24 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.85 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  39.05 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.43 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.5 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.64 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.75 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.95 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  43.26 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  32.56 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.61 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  41.11 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36.97 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.97 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.97 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  39.41 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.66 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  35.8 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.06 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  46.15 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  38.8 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.16 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  42.61 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.91 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.29 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.39 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  34.91 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  38.95 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  36.69 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  39.2 
 
 		 182 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  37.57 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.53 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.13 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.04 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  34.03 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  34.62 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.54 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  35.8 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.69 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.69 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  38.1 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.84 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.73 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.3 
 
 		 416 aa  81.3  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.32 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.71 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  35.8 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.8 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.5 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  28.31 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.66 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  30.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.41 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.3 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  30.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  30.46 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  36.72 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>