More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3664 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  100 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  64.33 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  64.71 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  64.71 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  64.12 
 
 		 175 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  63.13 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  61.27 
 
 		 176 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  60.11 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  61.27 
 
 		 176 aa  200  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  58.99 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  59.78 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  60.12 
 
 		 176 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  59.54 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  61.85 
 
 		 176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  61.8 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  61.8 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  62.15 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  52.87 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  59.77 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  59.2 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  61.02 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  61.49 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  59.32 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  53.93 
 
 		 178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  48.9 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  50.29 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  49.11 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  51.74 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  51.16 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  53.37 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  42.37 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.23 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.42 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.12 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  36.93 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  50.56 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  35.54 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  39.2 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.63 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.14 
 
 		 222 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  43.2 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  38.8 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.39 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  38.64 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.55 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.59 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.87 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.85 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.04 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.26 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.26 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  37.14 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.26 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.46 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  36.72 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.42 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.01 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  44.05 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.67 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.56 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.81 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  37.99 
 
 		 203 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.26 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.94 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.9 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  35.23 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  36.99 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.67 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  35.23 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.23 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  38.07 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.52 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.35 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.69 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.02 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.35 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  31.36 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.86 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  32.12 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  32.12 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  40.68 
 
 		 197 aa  84.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  32.12 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  29.76 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.46 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.72 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  35.26 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.2 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.33 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.72 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  29.41 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  33.72 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.47 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.14 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  27.75 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  25.3 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.11 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  28.24 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>