More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3505 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  85.47 
 
 		 179 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3921  cytochrome B561  45.4 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0127513  normal  0.0741318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  43.26 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  41.71 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  38.86 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  36.57 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  39.53 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.64 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.64 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  38.64 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  38.64 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  36.36 
 
 		 229 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  37.2 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  37.14 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  40.23 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  36.36 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  35.59 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  39.66 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  39.53 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  35.84 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  39.53 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  39.53 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  39.53 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  37.08 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  34.83 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  42.13 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  36.57 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.87 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  36.59 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  36.59 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  32.95 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  34.1 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  34.1 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  34.1 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.1 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.1 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.1 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  38.41 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.1 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.92 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  35.37 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  35.06 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  31.67 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.54 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  30.23 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  30.86 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.86 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  36.31 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  34.86 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.64 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  35.09 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.66 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.52 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  30.68 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.56 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.56 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.56 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  33.71 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.15 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  31.64 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  30.11 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  34.76 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.11 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  30.11 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  36.05 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  29.55 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.11 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  29.55 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  30.56 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.79 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  31.79 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  31.79 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  30.06 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  34.29 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  30.9 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.08 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.95 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  30.27 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  30.81 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.67 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.33 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  32.39 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  34.25 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  32.28 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.47 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  31.25 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>