More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2303 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  42.93 
 
 
188 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  38.3 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.17 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.17 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36.17 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.22 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.17 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  36.9 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.31 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  36.22 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.71 
 
 
178 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.68 
 
 
186 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.66 
 
 
203 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.17 
 
 
189 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.17 
 
 
186 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.64 
 
 
186 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.1 
 
 
188 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.22 
 
 
182 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.92 
 
 
185 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.52 
 
 
188 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  41.78 
 
 
416 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.51 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.17 
 
 
177 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  36.84 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.41 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.45 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.77 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.94 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  35.2 
 
 
441 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  33.16 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.69 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.92 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  35.45 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  35.45 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.39 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.04 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.39 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.67 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  37.04 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.89 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.92 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.16 
 
 
199 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.45 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  33.7 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.98 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.04 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.52 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  30.81 
 
 
177 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  34.04 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.85 
 
 
193 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  35.64 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  32.26 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  31.38 
 
 
188 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  34.57 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  33.87 
 
 
182 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  35.14 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.72 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.15 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.17 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  31.89 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  34.39 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  31.55 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.35 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  37.5 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.26 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  31.61 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.55 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.7 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.88 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.89 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  43.45 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  28.11 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  30.48 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  34.76 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  31.38 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  36.09 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  37.12 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  31.75 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.98 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  28.49 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.07 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.41 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  34.69 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  29.63 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  30.43 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  29.95 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  31.89 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  33.81 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  29.53 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.96 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  37.6 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  34.04 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  34.55 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  34.59 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  35.17 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  35.17 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  35.17 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>